Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYDE1Q6ZW31 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYDE1Q6ZW31 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms