Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC149Q6ZUS6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms