Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP47Q6ZTR5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP47Q6ZTR5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP47Q6ZTR5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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