Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
UBR3Q6ZT12 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
UBR3Q6ZT12 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
UBR3Q6ZT12 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBR3Q6ZT12 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms