Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC55Q6ZSA7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC55Q6ZSA7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC55Q6ZSA7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms