Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC73Q6ZRK6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC73Q6ZRK6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC73Q6ZRK6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC73Q6ZRK6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms