Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNI2Q6ZMN8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNI2Q6ZMN8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms