Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NSMFQ6X4W1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NSMFQ6X4W1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSMFQ6X4W1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms