Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VITQ6UXI7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VITQ6UXI7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VITQ6UXI7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms