Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO3Q6UWJ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO3Q6UWJ1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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