Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC137Q6PK04 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC137Q6PK04 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC137Q6PK04 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC137Q6PK04 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms