Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCE3

PGM2L1, Glucose 1,6-bisphosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM2L1Q6PCE3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGM2L1Q6PCE3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGM2L1Q6PCE3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGM2L1Q6PCE3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms