Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGB2Q6NT52 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CGB2Q6NT52 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms