Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LCN12Q6JVE5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms