Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ABLIM2Q6H8Q1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABLIM2Q6H8Q1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ABLIM2Q6H8Q1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABLIM2Q6H8Q1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABLIM2Q6H8Q1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABLIM2Q6H8Q1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABLIM2Q6H8Q1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms