Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RALGAPA1Q6GYQ0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RALGAPA1Q6GYQ0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms