Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF43Q68DV7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF43Q68DV7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF43Q68DV7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF43Q68DV7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF43Q68DV7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF43Q68DV7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF43Q68DV7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF43Q68DV7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF43Q68DV7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF43Q68DV7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms