Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG16L1Q676U5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms