Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLX4IPQ5VYV7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLX4IPQ5VYV7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms