Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXT5

SYPL2, Synaptophysin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL2Q5VXT5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYPL2Q5VXT5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYPL2Q5VXT5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYPL2Q5VXT5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms