Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP6Q5VW22 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AGAP6Q5VW22 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AGAP6Q5VW22 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms