Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MYOM3Q5VTT5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MYOM3Q5VTT5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MYOM3Q5VTT5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MYOM3Q5VTT5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MYOM3Q5VTT5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
MYOM3Q5VTT5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MYOM3Q5VTT5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
MYOM3Q5VTT5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
MYOM3Q5VTT5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
MYOM3Q5VTT5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
MYOM3Q5VTT5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
MYOM3Q5VTT5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
MYOM3Q5VTT5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
MYOM3Q5VTT5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
MYOM3Q5VTT5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
MYOM3Q5VTT5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
MYOM3Q5VTT5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
MYOM3Q5VTT5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
MYOM3Q5VTT5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms