Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF220Q5VTB9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF220Q5VTB9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms