Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GKAP1Q5VSY0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms