Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPANXN1Q5VSR9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms