Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BEND3Q5T5X7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
BEND3Q5T5X7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BEND3Q5T5X7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms