Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAX1Q5SQQ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
VAX1Q5SQQ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms