Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO47Q5MNV8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO47Q5MNV8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO47Q5MNV8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms