Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNT1Q5JUK3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms