Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A13Q5J8X5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MS4A13Q5J8X5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms