Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HERC4Q5GLZ8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC4Q5GLZ8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms