Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC3AQ59EK9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC3AQ59EK9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms