Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD39Q53RE8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms