Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CDCA8Q53HL2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CDCA8Q53HL2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CDCA8Q53HL2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDCA8Q53HL2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms