Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFTN2Q52LD8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFTN2Q52LD8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFTN2Q52LD8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms