Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM259Q4ZIN3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM259Q4ZIN3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms