Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R8

SLC22A6, Solute carrier family 22 member 6, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A6Q4U2R8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A6Q4U2R8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC22A6Q4U2R8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC22A6Q4U2R8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC22A6Q4U2R8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC22A6Q4U2R8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC22A6Q4U2R8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC22A6Q4U2R8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A6Q4U2R8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A6Q4U2R8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A6Q4U2R8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A6Q4U2R8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A6Q4U2R8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A6Q4U2R8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A6Q4U2R8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A6Q4U2R8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A6Q4U2R8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC22A6Q4U2R8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms