Protein–RNA interactions for Protein: Q49A17

GALNTL6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 6, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNTL6Q49A17 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALNTL6Q49A17 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNTL6Q49A17 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNTL6Q49A17 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms