Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SV2CQ496J9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SV2CQ496J9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SV2CQ496J9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms