Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCGF3Q3KNV8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCGF3Q3KNV8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCGF3Q3KNV8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms