Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTU2Q2VPK5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTU2Q2VPK5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTU2Q2VPK5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms