Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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SWI5Q1ZZU3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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SWI5Q1ZZU3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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SWI5Q1ZZU3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SWI5Q1ZZU3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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