Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q1T7F1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q1T7F1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q1T7F1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q1T7F1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q1T7F1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q1T7F1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q1T7F1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q1T7F1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q1T7F1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q1T7F1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q1T7F1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q1T7F1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q1T7F1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q1T7F1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q1T7F1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q1T7F1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q1T7F1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q1T7F1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q1T7F1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q1T7F1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q1T7F1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q1T7F1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q1T7F1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q1T7F1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q1T7F1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q1T7F1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q1T7F1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q1T7F1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q1T7F1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q1T7F1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q1T7F1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q1T7F1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q1T7F1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q1T7F1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q1T7F1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q1T7F1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q1T7F1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q1T7F1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q1T7F1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q1T7F1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q1T7F1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q1T7F1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q1T7F1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q1T7F1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q1T7F1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q1T7F1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q1T7F1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q1T7F1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q1T7F1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q1T7F1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q1T7F1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q1T7F1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q1T7F1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q1T7F1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q1T7F1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q1T7F1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q1T7F1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q1T7F1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q1T7F1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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