Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

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Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R3AQ16821 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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