Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGCBQ16585 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SGCBQ16585 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGCBQ16585 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCBQ16585 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCBQ16585 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCBQ16585 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SGCBQ16585 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCBQ16585 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCBQ16585 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCBQ16585 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCBQ16585 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCBQ16585 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCBQ16585 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCBQ16585 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCBQ16585 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCBQ16585 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCBQ16585 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCBQ16585 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCBQ16585 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCBQ16585 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGCBQ16585 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCBQ16585 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGCBQ16585 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGCBQ16585 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCBQ16585 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCBQ16585 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGCBQ16585 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGCBQ16585 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SGCBQ16585 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGCBQ16585 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGCBQ16585 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGCBQ16585 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SGCBQ16585 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SGCBQ16585 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGCBQ16585 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGCBQ16585 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGCBQ16585 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGCBQ16585 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGCBQ16585 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGCBQ16585 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGCBQ16585 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGCBQ16585 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGCBQ16585 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGCBQ16585 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SGCBQ16585 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGCBQ16585 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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