Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPE65Q16518 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPE65Q16518 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPE65Q16518 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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