Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRIK5Q16478 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GRIK5Q16478 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIK5Q16478 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
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