Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSX1Q16384 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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SSX1Q16384 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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SSX1Q16384 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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SSX1Q16384 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSX1Q16384 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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SSX1Q16384 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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SSX1Q16384 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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SSX1Q16384 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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SSX1Q16384 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX1Q16384 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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