Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
VPS72Q15906 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
VPS72Q15906 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
VPS72Q15906 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
VPS72Q15906 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
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