Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERC1Q15751 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC1Q15751 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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